Under et hemmelig oppdrag ved en avsidesliggende romstasjon oppdager Carl Jenkins den utenomjordiske armeens planer om en invasjon. Besetningen på romskipet Alesia får et redningsoppdrag som blir farligere enn noen kunne ane. Kampen mot de fiendtlige kjempekrypene fortsetter i den tredje dataanimerte oppfølgeren til den hyllede science fiction-thrilleren "Starship Troopers".